Con el fin de promover desde el ámbito escolar la cultura de la integridad, la transparencia y el control social, la Contraloría Municipal de Neiva desarrolla el Programa Contralor Estudiantil, en el que se vinculan estudiantes de las Instituciones Públicas y Privadas del Municipio. Los Contralores Estudiantiles son elegidos democráticamente en cada una de una, como parte del Gobierno Escolar.
La Contraloría Municipal de Neiva desarrolla un programa de formación y acompañamiento con el ánimo de fortalecer el rol que ejercen estos Líderes estudiantiles en el ejercicio del control social fiscal de los recursos que se invierten en sus instituciones.